通过基因组测序提供苏门答腊犀牛的生存期的希望和警告

研究人员在斯德哥尔摩皇冠学中心领导的一项研究表明，苏门答腊犀牛的最后剩余群体展示令人惊讶的近亲繁殖。研究人员从21个现代和历史犀牛的标本中排序，使他们能够调查今天犀牛的遗传健康以及最近灭绝的人口。这些调查结果今天（4月26日）在期刊上发表自然通信。

剩下少于100人，苏门答腊犀牛是世界上最濒危的哺乳动物之一。最近对健康问题和低繁殖力的报道提出了担心剩余的人群遭受近亲繁殖的问题。然而，关于这些神秘犀牛的遗传状态，很少有人知道。

为了调查苏门答腊犀牛是否受到遗传因素威胁的威胁，研究人员从代表婆罗洲和苏门答腊的当前人口以及马来西亚半岛上最近灭绝的人口的16个个体中排序的基因组。这使他们能够估计群体中的近亲繁殖水平，遗传变异和潜在有害突变的频率。此外，通过还测序来自五个历史样本的基因组，研究人员可以调查过去100年来严重的人口衰退的遗传后果。

“令我们惊讶的是，我们在婆罗洲和苏门答腊州的当今人口中发现了相对较低的近亲繁殖水平和高遗传多样性，”古代生物科学中心和联合主导作家的博士学生博士生。

研究人员认为，当今犀牛的相对低的近亲繁殖水平是由于最近发生的人口大小的下降。这意味着近亲繁殖尚未赶上目前的小人口大小。这是对剩余种群的保护管理的好消息，因为它意味着仍有时间保留物种的遗传多样性。然而，研究人员还发现，这些人的基因组中存在许多潜在的有害突变，这可能会为未来拼写坏消息。

“除非人群的规模开始增加，否则有很高的风险，近亲繁殖水平将开始上升，因此遗传疾病将变得更加常见，”注意到古代遗传学中心的博士后研究员也会导致研究的博士后研究员。

研究团队从马来西亚半岛最近灭绝的人口的调查结果作为婆罗洲和苏门答腊在婆罗洲和苏门答腊剩余的群体发生的剧烈警告。历史和现代基因组的比较表明，马来西亚半岛人口在灭绝之前经历了近亲繁殖水平的迅速增加。此外，研究人员观察到与近亲繁殖抑郁症的潜在有害突变频率的变化，这是一种密切相关的父母产生患有遗传疾病的后代的现象。这些结果意味着如果他们的近亲繁殖水平开始增加，这两个剩余的群体可能会遭受类似的命运。

“Sumatran Rhino绝不是树林。但至少我们的调查结果提供了一条前进的道路，我们可能仍然能够拯救大部分物种的遗传多样性，“古代生物中心中心的进化遗传学教授的爱情达尔·恩斯说。

为了尽量减少灭绝的风险，研究人员表示，人口大小增加了。他们还表明，可以采取行动来实现婆罗洲和苏门答腊之间的基因交换，例如通过易于转移个体或使用人工授精。来自这两个岛屿的基因组的比较不提供证据表明这种遗传交换可能导致引入对当地环境不太适应的基因。研究人员还指出，基因组测序可以用作识别具有低量潜在有害突变的特定个体的工具，并且这些个体将特别适合这种类型的遗传交换。

在更广泛的角度下，该研究突出了现代基因组测序技术在全球濒危物种的指导养护工作中的潜力。该研究得到了瑞典的Scilifelab国家基因组织基础设施的支持，是来自几个不同国家的研究人员之间的合作，包括遗传学家以及关于保护管理和生殖生物学的专家。俄罗斯比利时赔率

Reference: “Genomic insights into the conservation status of the world’s last remaining Sumatran rhinoceros’ populations” by Johanna von Seth, Nicolas Dussex, David Díez-del-Molino, Tom van der Valk, Verena E. Kutschera, Marcin Kierczak, Cynthia C. Steiner, Shanlin Liu, M. Thomas P. Gilbert, Mikkel-Holger S. Sinding, Stefan Prost, Katerina Guschanski, Senthilvel K. S. S. Nathan, Selina Brace, Yvonne L. Chan, Christopher W. Wheat, Pontus Skoglund, Oliver A. Ryder, Benoit Goossens, Anders Götherström and Love Dalén, 26 April 2021,自然通信。
DOI：10.1038 / S41467-021-22386-8

资金：L.D.和J.Vs.确认Formas的支持，N.D.由瑞士国家科学基金会和Carl Tryggers Foundation，D.D.DM资助。通过Carl Trygers奖学金支持

Paleogenetics中心是由斯德哥尔摩大学和瑞典自然历史博物馆资助的联合研究中心。